Søopmåling i de danske og grønlandske farvande, må kun foretages med tilladelse fra Geodatastyrelsen, jf. Lov om stedbestemt information § 7. Tilladelseskravet omfatter både søopmåling til kommercielle formål, myndighedsopgaver samt i forbindelse med systematisk opmåling af vrag.
Udenlandske opmålingsfartøjer følger samme ansøgningsproces som danske fartøjer. Er der tale om udenlandske statsskibe, kan ansøgning om tilladelse til arbejde i danske, færøske eller grønlandske farvande fremsendes via diplomatiske kanaler af flagstaten.
Det er ikke nødvendigt at søge om tilladelse til opmåling af havne, da dette hører under den enkelte havns ansvarsområde. Geodatastyrelsen kræver heller ikke en søopmålingstilladelse, når havne får kontrolmålt sejlrenden ind mod havnen, selv om renden strækker sig ud over havnens område. Såfremt havnen ønsker opmålingen optaget i søkortet, skal data afleveres til Geodatastyrelsen til kontrol og kvalitetssikring. Tidspunktet for udgivelse afhænger af Geodatastyrelsens udgivelsesplan.
En tilladelse fra Geodatastyrelsen omfatter ikke geotekniske bundundersøgelser. For sådanne aktiviteter skal Energistyrelsen kontaktes.